luogu#P4059. [Code+#1] 找爸爸
[Code+#1] 找爸爸
题目描述
小 A 最近一直在找自己的爸爸,用什么办法呢,就是 DNA 比对。
小 A 有一套自己的 DNA 序列比较方法,其最终目标是最大化两个 DNA 序列的相似程度,具体步骤如下:
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给出两个 DNA 序列,第一个长度为 ,第二个长度为 。
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在两个序列的任意位置插入任意多的空格,使得两个字符串长度相同
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逐位进行匹配,如果两个序列相同位置上的字符都不是空格,假设第一个是 ,第二个是 ,那么他们的相似程度由 定义。对于两个序列中任意一段极长的长度为 的连续空格,我们定义这段空格的相似程度为 。
那么最终两个序列的相似程度就是所有的 加上所有的极长空格段的相似程度之和。
现在小 A 通过某种奥妙重重的方式得到了小 B 的 DNA 序列中的一段,他想请你帮他算一下小 A 的 DNA 序列和小 B 的 DNA 序列的最大相似程度。
输入格式
输入第 行一个字符串,表示小 A 的 DNA 序列。
输入第 行一个字符串,表示小 B 的 DNA 序列。
接下来 行,每行 个整数,用空格隔开,表示 数组,具体顺序如下所示。
d(A,A) d(A,T) d(A,G) d(A,C)
d(T,A) d(T,T) d(T,G) d(T,C)
d(G,A) d(G,T) d(G,G) d(G,C)
d(C,A) d(C,T) d(C,G) d(C,C)
最后一行两个用空格隔开的正整数 ,意义如题中所述。
输出格式
输出共一行,表示两个序列的最大相似程度。
ATGG
ATCC
5 -4 -4 -4
-4 5 -4 -4
-4 -4 5 -4
-4 -4 -4 5
2 1
4
提示
样例解释
首先,将序列补成如下形式("-"代表空格)
ATGG--
AT--CC
然后所有 的和为
所有极长连续空格段的相似程度之和为
总和为 ,可以验证,这是相似程度最大的情况。
对于所有测试点,有 $0< B<A \le 1000, -1000\le d(x,y)\le 1000,d(x,y)=d(y,x)$,序列只包含四种字符。
来自 CodePlus 2017 11 月赛,清华大学计算机科学与技术系学生算法与竞赛协会 荣誉出品。
Credit:idea/卢政荣 命题/卢政荣 验题/何昊天
Git Repo:https://git.thusaac.org/publish/CodePlus201711
感谢腾讯公司对此次比赛的支持。